Інститут кібернетики імені В.М.Глушкова

Вычислительный комплекс СКИТ ИК НАН Украины

СКИТ - 4

12-узловой кластер на многоядерных процессорах Intel Xeon E5-2600

Кластер базируется на новейшей платформе HP ProLiant Gen8 BladeSystems и имеет следующие характеристики:

  • кластер состоит из 12 узлов на базе центральных процессоров Intel Xeon E5-2600 с частотой 2.6 ГГц, имеет 192 вычислительных ядра, 36 ускорителей NVidia Tesla M2075, 768 ГБ оперативной памяти;
  • интегрирован с общим хранилищем данных кластерного комплекса объемом 100 ТБ;
  • сеть передачи данных между узлами Infiniband FDR 56 Гбит/с.

Каждый узел имеет реальную производительность 1 ТФлопс, 16 ядер (32 в режиме HyperThreading), 64 ГБ оперативной памяти, 3 ускорителя NVidia Tesla M2075.

В общем кластер имеет следующие характеристики производительности:

  • пиковая производительность 25,6 ТФлопс;
  • реальная производительность 10 ТФлопс.

СКИТ-4 в 2 раза мощнее, чем СКИТ-3, при этом меньше по размерам и потребляет значительно меньше электроэнергии — 15 кВт против 60 кВт для СКИТ-3.

СКИТ - 3

127-узловой кластер на многоядерных процессорах (75 узлов на двухъядерных процессорах Intel Xeon 5160 и 52 узла на четырехъядерных процессорах Xeon 5345)

scit3

Пиковая производительность кластера 7500 Гфлопс, реальная подтвержденная производительность (на 125 узлах) 5317 Гфлопс.

Тип процессоров - двухъядерный Intel Xeon 5160 и четырехъядерный Intel Xeon 5345 с архитектурой EM64T (тактовая частота сооответственно - 3,0 ГГц и 2,2 ГГц, кэш - 4 Мбайт, потребляемая мощность 80 Вт, число процессоров в узле кластера - 2).

Оперативная память узла - 2 ГБайта на ядро, соответственно, 8 и 16 ГБайт.

Число ядер-процессоров в узле соответственно - 4 и 8, всего в кластере 716 ядер.

Система хранения данных - типа RAID5, глобальная файловая система Lustre общим объемом (в зеркале) 20 Тбайт.

Общая потребляемая мощность - 60 кВА от сети 380 В.

Вычислительные средства кластера (вычислительные узлы и управляющий узел) представляют собой массив серверов, связанных между собой двумя ЛВС - высокоскоростной сетью InfiniBand (пропускная способность канала до 900 Мбайт/с) и сетью Gigabit Ethernet (пропускная способность канала до 1000 Мбит/с).

Сеть InfiniBand предназначена для высокоскоростного обмена между узлами в ходе вычислений. При обмене данными между двумя узлами по сети InfiniBand с использованием протоколов MPI может быть достигнута пропускная способность 850 Мбайт/с.

Сеть Gigabit Ethernet предназначена для соединения всех вычислительных узлов кластера с управляющим узлом и файл-сервером.

СКИТ - 2

32-узловой кластер на микропроцессорах Intel Itanium2

scit2

Пиковая производительность кластера 360 Гфлопс, реальная производительность 280 ГфлопсСеть Gigabit Ethernet предназначена для соединения всех вычислительных узлов кластера с управляющим узлом и файл-сервером.

Тип процессора - одноядерный 64-разрядный Intel Itanium2 (тактовая частота - 1,4 ГГц, кэш - 3 Мбайт, потребляемая мощность 135 Вт, число процессоров в узле кластера - 2)

Оперативная память узла - 2 ГБайта

Число ядер-процессоров в узле - 2

Система хранения данных - типа RAID5, глобальная файловая система общим объемом 20 Тбайт

Общая потребляемая мощность - 20 кВА от сети 380 В

Вычислительные средства кластера (вычислительные узлы и управляющий узел) представляют собой массив серверов, связанных между собой двумя ЛВС - высокоскоростной сетью SCI (пропускная способность канала 350 Мбайт/с) и сетью Gigabit Ethernet (пропускная способность канала до 1000 Мбит/с).

Сеть SCI предназначена для высокоскоростного обмена между узлами в ходе вычислений. При обмене данными между двумя узлами по сети SCI с использованием протоколов MPI может быть достигнута пропускная способность 345 Мбайт/с.

СКИТ - 1

24-узловой кластер на микропроцессорах Intel Xeon

scit1

Пиковая производительность кластера 255 Гфлопс (1 Гфлопс = 1 млрд.операций с плавающей запятой в секунду), реальная производительность 189 Гфлопс.

Тип процессора - одноядерный 32-разрядный Intel Xeon (тактовая частота - 2,67 ГГц, кэш - 512 Кбайт, потребляемая мощность 60-100 Вт, число процессоров в узле кластера - 2).

Число ядер-процессоров в узле - 2.

Оперативная память узла - 2 ГБайта.

Система хранения данных - обслуживает все кластеры, типа RAID5, глобальная файловая система общим объемом 20 Тбайт.

Общая потребляемая мощность - 8 кВА от сети 380 В.

Вычислительные средства кластера (вычислительные узлы и управляющий узел) представляют собой массив серверов, связанных между собой двумя ЛВС - высокоскоростной сетью Infiniband (пропускная способность канала 800 Мбайт/с) и сетью Gigabit Ethernet (пропускная способность канала до 1000 Мбит/с).

Сеть Infiniband предназначена для высокоскоростного обмена между узлами в ходе вычислений. При обмене данными между двумя узлами по сети Infiniband с использованием протоколов MPI может быть достигнута пропускная способность 750 Мбайт/с.

Сеть Gigabit Ethernet предназначена для соединения всех вычислительных узлов кластера с управляющим узлом и файл-сервером.

 

 

https://icybcluster.org.ua/index.php?lang_id=1&menu_id=5

 
об’єм обчислювальних ресурсів, що надаються в Український національний грід 
      1 2 3 4   ітого    
кількість процессорів(ядер) 52(416) 75(300)       127(716)    
характеристика  (тип) 2*4 Xeon 2*2 Xeon            
                     
розмір дискового простору      
      60 Тб (заплановане розширення)        
опис політики виконання грід-завдань в локальній системі управління кластером:
загальна черга з рівними приорітетами (рівноправне виконання грід-завдань і локальних завдань),
перевага завдань з встановленим коротким часом виконання над задачами з довгим і необмеженим часом, 
спеціальні черги коротких локальних задач (до 2 годин) і задач для графічних прискорювачів (GPGPU)
 
 
 

Новая система управления кластером SCMS-EMI

Уважаемые пользователи кластера!

На кластере установлена новая система управления SCMS-EMI.

Система поддерживает работу с локальным кластером и в гриде.

Сейчас система находится в режиме тестирования. Попробовать ее в работе можно по ссылке:http://icybcluster.org.ua:29080/

Для доступа используйте свой логин и пароль.

Все замечания, впечатления и вопросы касательно работы в новой системе пишите по адресу: icybcluster@gmail.com

 

Прикладное программное обеспечение

Интеллектуальный пакет PREDICTOR

Назначение пакета Predictor – статистическое прогнозирование в бизнес-расчетах,  например, с целью анализа объемов предполагаемых продаж, выбора ассортимента товаров и услуг по спрогнозированным ценам,  удовлетворения потребностей в численности персонала.

Обзор программного обеспечения СКИТ

На комплексе СКИТ установлен широкий спектр компиляторов для разных языков программирования, биолиотеки для различных направлений, а также готовое программное обеспечение.

Пакет NAMD

Пакет молекулярной динамики NAMD предназначен для моделирования сверхбольших биологических объектов на суперкомпьютерах и обладает высокой степенью масштабируемости по количеству вычислительных ядер.

Для начала работы с пакетом достаточно взять как пример профиль namd в форме запуска.

Пакет Gromacs

На кластере СКИТ установлен пакет молекулярной динамики Gromacs 4.0.7.

Для начала работы достаточно выбрать профиль gromacs в форме запуска.

Также установлена портированная версия силовых полей ffAMBER. Для ее использования выберите профиль gromacs-4.0.7-AMBER.

Использование пакета Abinit

На кластере СКИТ установлен пакет квантовой химии Abinit 5.7. Для начала работы достаточно выбрать профиль abinit в форме запуска.

Использование пакета GAMESS

На кластере СКИТ установлен пакет квантовой химии GAMESS версий 2007 и 2009 года. Для начала работы достаточно выбрать профиль gamess в форме запуска.

Использование пакета NWChem

Программа NWChem — популярный пакет вычислительной химии на суперкомпьютерах с кластерной архитектурой.

 

 

 

 

 

Менеджер: Тульчинський Вадим Григорович
Сістемний адміністратор: Бандура Олександр Юрійович
Адреса: Україна, м.Київ, пр. Академіка Глушкова, 40
E-mail: icyb146@gmail.com